地図にも載っていない小さな美しい島・ナンデモランド。そこに洋裁の達人である母ニーナと2人きりで住む少年ジム。
平和な島は海賊たちに荒らされ、ジムボタンの大好きな機関士・ルーカスおじさんは魔法弾によって石にされ、愛すべき同級生の女の子ボッコは鳩に変えられてしまった。そして、大事なニーナお母さんはこうもり男爵にさらわれてしまった。　
ジムボタンはボタン家に伝わるボタンを握ると、ルーカスおじさんの機関車エマ号に飛び乗って海賊を追ったが…
　ミヒャエル・エンデの長編童話『ジム・ボタンの冒険』を原作とするアニメーション。